Всю тему не осилил
Вы определитесь, по питанию ли идет помеха, или это наводка (а может и то и другое). Мистери спасет только от помех компа. Попробуйте минус питания завести от аккумулятора, а не с корпуса брать, проследите чтобы не было множественных подключений массы. А вообще, хорошо бы осциллографом проверить напряжение на выходе фильтра питания.
Ну и сам генератор, кстати! Бывает, выгорает один диод в мосте, и все начинает фонить. У меня сейчас такая беда. Даже через моторчик печки можно слышать вой генератора

Нужно проверять форму сигнала от гены