А дело скорее всего не в искре, не может искра на контактах такую мощную помеху дать и не отвалится по ней USB. А вот индуктивность обмотки может, особенно если учесть, что даст она ее в негальванически развязанную часть и дальше в USB и в питание. Диоды защитные стоят параллельно обмотке реле?
