[Димон]

1. Сначала лучше всеже принципиальную схему из символов в Shematic нарисовать, а потом привязывать к ним корпуса, а потом корпуса-дорожки в PCB. Заодно и контроль ошибок будет работать.
2. Блекло возможно изза того, что дорожки в нижнем слое а элементы - в верхнем. Попробуй перейти в редактирование нижнего. Еще можно попереключать вид - контраст-некотраст и т.п.
3. Слои можно включать-отключать, например чтобы напечатать только дырки-дорожки. Еще можно сделать сохранение в gerber-формат. Там все слои отделны.